Le tattiche di tutti i piloti, che hanno speculato sulla pioggia, sono state fatte saltare dal fenomeno Marc Marquez, che ha utilizzato gli pneumatici da asciutto. Lo spagnolo ha conquistato la pole position in MotoGP a Brno disintegrando la concorrenza e rifilando più di 2" a tutti. Dalla seconda piazza scatterà l'australiano Jack Miller, staccato di 2"524, mentre a completare la prima fila sarà Johann Zarco (+2"598). Quarto Andrea Dovizioso (+2"837).
Per quanto riguarda le Moto2, Thomas Lüthi si è dovuto accontentare della 12a posizione a più di 6" da Alex Marquez, suo antagonista in classifica generale, mentre l'altro elvetico Dominique Aegerter si è piazzato 26o. Nelle Moto3 sarà l'italiano Tony Arbolino a partire dalla pole position, dopo che nelle qualifiche ha preceduto il britannico John McPhee e il connazionale Niccolò Antonelli.